Makšties mikrobiomo tyrimų metodai ir vertinimo principai

Santrauka

Makšties mikrobiota turi svarbią funkcinę reikšmę moters reprodukcinei sistemai ir bendrai savijautai. Mikrobiomo tyrimai, naudojant pažangius genetinius metodus, tokius kaip 16S rRNR amplikono sekoskaita, metagenominė ir metatranskriptominė sekoskaita, leidžia nuodugniai įvertinti mikroorganizmų taksonomiją ir svarbių genų raišką. Šie metodai padeda suprasti mikrobiotos struktūrinius pokyčius, kurie lemia sergamumą tam tikromis ligomis. Masių spektrometrija pagrįsta metabolomika ir metaproteomika suteikia galimybę tirti mikrobiomo ir žmogaus ląstelių sąveiką bei nustatyti potencialius tam tikrų ligų žymenis. Bioinformatiniai įrankiai ir algoritmai yra svarbūs prognozuojant mikroorganizmų gaminamų metabolitų, baltymų poveikį šeimininko ląstelėms, todėl gali prisidėti prie ginekologinių ligų diagnostikos ir gydymo gerinimo ateityje. Šiame straipsnyje apžvelgiami pagrindiniai makšties mikroorganizmų genetinės medžiagos tyrimo metodai ir gautų duomenų bioinformatiniai analizės būdai.